マレーシア政府が首都クアラルンプール郊外に位置するクアラルンプール国際空港の近郊に、近代化政策の一環として１億米ドルを投じ、２,３００エーカーの敷地にショッピングセンター、ホテル、ゴルフコース、複数のスポーツ施設と共にセパン・インターナショナル・サーキットを建設。僅か１４ヶ月で建設が完成すると、過去に開催されていたシャー・アラム・サーキット、ジョホール・サーキットに替わって、翌年の１９９９年から『MotoGP™世界選手権』とＦ１世界選手権を毎年開催。

最初の２年間は４月に開催されたが、２００１年からフライアウェイ・ラウンドの３連戦の１つとして毎年１０月に開催。赤道に近い立地から高温多湿であるため、ライダーたちはシーズンで最も過酷なレースを強いられる。

毎年５万人程度の観衆を集めていたが、２００９年に２倍の１０万人に膨らむと、２０１５年には初めて１５万人を突破。

２０１６年１０月、マレーシアＧＰ開催期間中に、セパン・インターナショナル・サーキットとドルナスポーツとの間で、２０１７年から５年間の延長開催に関して合意し、２０２１年までの開催が決定。

２１年連続の開催が予定されていた２０２０年は、新型コロナウイルスの影響を受けて開催をキャンセル。

２０２１年は、シーズンの１８戦目として１０月３１日に決勝レースの開催を予定する。